Neben vielfältigen Kooperationen zu einer Vielzahl von Kliniken und Instituten des UKSH und der CAU zu Kiel (z.B. Institute für Anatomie / Pathologie / Experimentelle Tumorforschung / Immunologie; Kliniken für Neurologie / Radiologie und Neuroradiologie etc.) bestehen auch enge Anbindungen an die Technische Fakultät der CAU zu Kiel sowie zahlreiche überregionale und internationale Kooperationen (z.B. Max-Planck-Institut für Evolutionsbiologie Plön; Schwerpunkt Kinderneurochirurgie, Klinik für Neurochirurgie, UMGöttingen; Klinik für Neurochirurgie, LMU München; Max Delbrück Zentrum für Molekulare Medizin Berlin, Zelluläre Neurowissenschaften).