Das IRuN ist in das von der Berufsfeuerwehr Kiel betriebene Notarztsystem der Landeshauptstadt Kiel eingebunden und besetzt mit seinen Fachärztinnen und Fachärzten anteilig die Notarzteinsatzfahrzeuge (NEF), das Verlegeeinsatzfahrzeug (VEF) und den Intensivtransportwagen (ITW).
Des Weiteren sind aus dem Institut für Rettungs- und Notfallmedizin vier Kollegen Mitglieder der Leitenden Notarztgruppe. Diese vier sind Fachärzte mit einer langjährigen Einsatzerfahrung im Rettungsdienst.