Ein wesentliches Instrument zur Qualitätssicherung ist das im Institut für Pathologie implementierte Qualitätsmanagementsystem, das sich an den Anforderungen der Norm DIN EN ISO 9001:2015 orientiert.
Seit Juli 2007 ist das Institut nach DIN EN ISO/IEC 17020 als Inspektionsstelle Typ C akkreditiert. Seitdem wurde und wird das Institut regelmäßig seitens der DAkkS überwacht.