Leistungsspektrum

Alle Untersuchungen können grundsätzlich an formalinfixierten paraffineingebetteten Gewebeproben, Schnittpräparaten oder EDTA-Blut durchgeführt werden.

Bitte senden Sie uns für sämtliche Analysen geeignetes Tumormaterial: Der Paraffinblock sollte Tumorareale mit >20% Tumorzellgehalt enthalten.

Für Mikrosatelllitenanalysen bitte zusätzlich Normalgewebe schicken (Areale auf separatem Block oder Tumorblock); falls nicht vorhanden, können 5 ml EDTA-Blut verwendet werden.

Sollte eine EGFR-Mutationsanalyse an ccfDNA („Liquid Biopsy“) gewünscht sein, kontaktieren Sie uns bitte gerne im Vorfeld.

Tumorspezifische Panel-Diagnostik

Nichtkleinzellige Lungenkarzinome (Adenokarzinome): Parallelsequenzierung KRAS, EGFR, ERBB2 (Her2), BRAF, PIK3CA, MET, STK11, TP53; zusätzlich FISH-Analyse ALK, RET, ROS1, MET und zusätzliche IHC von ALK, ERBB2 (Her2), NTRK, PD-L1

Nichtkleinzellige Lungenkarzinome (Plattenepithelkarzinome): Parallelsequenzierung BRAF, DDR2, EGFR, KRAS, MET, PTEN, PIK3CA, STK11, TP53; zusätzlich FISH-Anayse FGFR1, MET und zusätzlich IHC von PD-L1

Nichtkleinzellige Lungenkarzinome (NOS):  Parallelsequenzierung BRAF, DDR2, EGFR, ERBB2 (Her2), KRAS, MET, PTEN, PIK3CA, STK11, TP53 zusätzlich FISH-Analyse ALK, RET, ROS1, MET, FGFR1 und zusätzliche IHC von ALK, ERBB2 (Her2), NTRK, PD-L1

Kolorektalkarzinome: Parallelsequenzierung KRAS, NRAS, BRAF, ERBB2, KRAS, NRAS, PIK3CA, TP53

Melanome: Panel 1: Parallelsequenzierung BRAF, NRAS; KIT und Panel 2: Parallelsequenzierung BRAF, CDKN2A, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, KIT, KRAS, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, TP53

Gastrointestinale Stromatumoren (GIST): Parallelsequenzierung KIT, PDGFRA

Cholangiozelluläres Karzinom: Parallelsequenzierung BRAF, FGFR2, IDH1, IDH2, KRAS, PIK3CA, TP53; zusätzlich FISH-Diagnostik FGFR2-Amplifikation, FGFR2-Translokation, RET-Translokation

nNGM Panel v2.0

Hotspots in: ALK, BRAF, CTNNB1, EGFR, ERBB2, HRAS, IDH1, IDH2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, KEAP1, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PIK3CA, PTEN, RET, ROS1, STK11, TP53

(Lunge NSCLC)

PCR-basierte Verfahren

Parallelsequenzierung (DNA-Sequenzierung mittels Multiplex PCR-basierter Panel)

Ion AmpliSeq™ Colon and Lung Cancer Research Panel v2, Thermo Fisher: relevante Genabschnitte aus 22 Genen

(Kolorektalkarzinom, Lungenkarzinome)

Oncomine™ BRCA Research Assay, Thermo Fisher: BRCA1- und BRCA2-Gene

(Ovarialkarzinom, Pankreaskarzinom, Prostatakarzinom)

Oncomine BRCA Expanded Panel, Thermo Fisher: BRCA1 and 2, ATM, BARD1, BRIP1, CDK12, CHEK2, FANCD2, MRE11, NBN, PALB2, PPP2R2A, RAD51B, RAD54L, and TP53

(Prostatakarzinom, Ovarialkarzinom, Pankreaskarzinom)

Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2, Thermo Fisher: relevante Genabschnitte aus 50 Genen

(verschiedene Tumorentitäten)

EGFR p.T790M-Resistenztestung mittels Ion AmpliSeq™ Colon and Lung Cancer Research Panel v2, Thermo Fisher

(Lungen Adenokarzinom)

nNGM Panel v2.0: relevante Genabschnitte aus 26 Gene (NSCLC)

Parallelsequenzierung (RNA-Sequenzierung)

OFA RNA-Panel:  bekannte Fusionen / Splicevarianten von ABL1, AKT3, ALK, AXL, BRAF, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PPARG, RAF1, RET, ROS1.

Sanger-Sequenzierung

ASXL1 Ex.13 (MDS, AML, CMML)

BRAF Ex.15 (Kolorektalkarzinom, Malignes Melanom, Lungen Adenokarzinom)

CALR Ex.9 (Myeloproliverative Erkrankungen)

EGFR Ex.18,19,20,21 (Lungen Adenokarzinom)

ESR1 Ex. 7, 9 und 10 (Mammakarzinom)

FLT3 Ex.14,15,20 (AML)

GNA11, GNAQ Ex.5 (Uveales Melanom)

JAK2 Ex.12,14 (Myeloproliverative Erkrankungen)

KRAS Ex.2,3,4 (Kolorektalkarzinom, Lungen Adenokarzinom)

KIT Ex.9,10,11,13,14,15,17,18 (GIST, Malignes Melanom, Mastozytose)

MPL Ex.10 (Myeloproliverative Erkrankungen)

MYD88 Ex.5 (ABC-DLBCL, Morbus Waldenström)

NPM1 Ex.11 (AML)

NRAS Ex.2,3,4 (Kolorektalkarzinom, Malignes Melanom)

PDGFRA Ex.12,14,18 (GIST)

PIK3CA Ex.10,21 (Kolorektalkarzinom, Lungen Adenokarzinom, Plattenepithelkarzinome)

POLE Ex.9,10,11,12,13,14 (Ovarial-und Endometriumkarzinome)

STAT3 Ex.21 (T-LGL, CLPD-NK)

TERT-Promoter –Mutationen ( c.-124C>T, c.-146C>T) (Glioblastome, Blasenkrebs, Melanome, Schilddrüsenkarzinom)

Klonalitätsanalyse (Lymphomdiagnostik)

T-Zellrezeptor-Beta-Genlocus (T-Zell-Lymphome)

T-Zellrezeptor-Gamma-Genlocus (T-Zell-Lymphome)

Immunglobulin-Schwerketten-Genlocus (B-Zell-Lymphome)

Immunglobulin-Leichtketten-Genlocus (B-Zell-Lymphome)

Fragmentlängenanalyse

STR-Analyse (Ausschluss/Nachweis Materialvertauschung/Identifizierung)

Mikrosatelliteninstabilität (HNPCC): Für diese Untersuchung sind Tumor- und Normalgewebe eines Patienten erforderlich.

Allelspezifische PCR

t (11;14), BCL1 (Mantelzell-Lymphom)

t (14;18), BCL2 (Follikuläres Lymphom)

KIT p.D816V (Mastozytose)

Erregernachweis

Bartonella henselae („Katzenkratzkrankheit“)

Borrrelia burgdorferi

Epstein-Barr-Virus, EBV (EBV-Lymphoproliferationen, IM, Hodgkin-Lymphom)

Humanes Herpesvirus Typ 8, HHV8 (Castleman-Lymphom, primäres Effusionslymphom, Kaposi – Sarkom)

Humane Papillomvieren, HPV

Herpes-simplex-Virus 1, HSV 1

Herpes-simplex-Virus 2, HSV 2

Mycobacterium tuberculosis und atypische Mykobakterien

Pathogene Pilze

Tropheryma whipplei (Morbus Whipple)

Varizella-Zoster-Virus, VZV

FISH-Analysen

Solide Tumoren

ALK/EML4-Translokation (Lungen Adenokarzinom)

DDIT3-Translokation (Myxoides Liposarkom)

EWSR1-Translokation (Ewingsarkom, weitere Sarkome)

FGFR1 Amplifikation (Plattenepithelkarzinome der Lunge und des Kopf-Hals-Bereiches, Mammakarzinom)

FGFR2 Amplifikation (Magenkarzinome, Mammatumore)

FGFR2 Translokation (Cholangiokarzinome, Lunge-, Prostata- und Schilddrüsenkarzinome)

FGFR3 Amplifikation (Blasenkarzinomen und Speicheldrüsenkarzinomen)

FGFR3 Translokation ( multiples Myelom, in Blasentumoren, Glioblastomen, Plattenepithelkarzinomen der Lunge und des Kopf-Hals-Bereiches)

FKHR-Translokation (Alveoläres Rhabdomyosarkom)

HER2/neu-Amplifikation (Mammakarzinom, Magen Adenokarzinom, Lungen Adenokarzinom)

MET-Amplifikation (Lungen Adenokarzinom, Therapieresistenz)

MDM2-Amplifikation (Liposarkom)

NTRK1-3 Translokation (Lungen-, Mamma-, Colon-, Pankreas-, und Schilddrüsen Karzinome, GIST, Melanom, Sarkome)

RET-Translokation (Lungen Adenokarzinom)

ROS1-Translokation (Lungen Adenokarzinom)

SYT-Translokation (Synovialsarkom)

Hämatologische Erkrankungen

ALK-Translokation (ALCL)

BCL1-Translokation (Mantelzell-Lymphom, CLL)

BCL2-Translokation (Follikuläres Lymphom, DLBCL)

BCL6-Translokation (DLBCL)

BCR/ABL-Translokation (CML, ALL)

IGH-Translokation (B-Zell-Lymphome)

MALT1-Translokation (MALT-Lymphom)

MYC-Translokation (Burkitt-lymphom, DLBCL)